До объявления независимости Южного Судана в 2011 году, его история тесно связана с историей Республики Судан. Возникновение этих двух государств относится к периоду фараонов, когда было создано королевство Керма (около 2500 — 1500 до н. э.), затем правление Нового Египетского царства (около 1500 до н. э. — 1070 до н. э.) и Королевства Куш (около 785 до н. э. − 350 н. э.).
После падения Куша нубийцы образовали три христианских королевства — Нобатия, Макурия и Алодия, причем последние два просуществовали примерно до 1500 года. Между XIV и XV веками большая часть Судана была постепенно заселена арабскими кочевниками. С XVI по XIX века в центральном и восточном Судане доминировал султанат Фундж, в то время как Дарфур правил западом, а османы — востоком.
С начала XIX века весь Судан был завоеван египтянами при династии Мухаммеда Али, когда Судан получил свои современные границы и начал процесс политического, сельскохозяйственного и экономического развития.
В 1881 году националистические настроения в Египте привели к восстанию Ораби, ослабившему власть египетской монархии и приведшему к оккупации Египта британской короной. В то же время религиозно-националистический пыл в Судане разгорелся в результате восстания махдистов, возглавляемого самопровозглашенным Махди Мухаммедом Ахмадом и приведшего к созданию халифата Омдурман.
Силы махдистов были разгромлены совместными египетско-британскими вооруженными силами. Власть египетского монарха была восстановлена, но
египетский суверенитет в Судане являлся лишь номинальным, поскольку истинной властью в Египте и в Судане являлась Британия.
В 1899 году под давлением Великобритании Египет согласился разделить суверенитет над Суданом с Соединенным Королевством в качестве кондоминиума, а фактически Судан управлялся как британское владение.
В ХХ веке начался рост как египетского, так и суданского национализма за прекращение оккупации Британии. Египетская революция 1952 года свергла монархию и потребовала вывода британских войск из Египта и Судана.
Мухаммад Нагиб, один из двух соруководителей революции и первый президент Египта, который был наполовину суданцем и вырос в Судане, требовали независимости Судана от революционного правительства.
В 1953 году, под давлением Египта и Судана, британская корона согласилась прекратить свой совместный суверенитет над Суданом и предоставить ему независимость.
1 января 1956 года Судан провозгласил себя независимым государством.
Конфликт Севера и Юга начались практически сразу же после провозглашения независимости Судана. Антагонизм был исторически обусловлен во многом тем, что север Судана населен преимущественно мусульманами, а юг христианами и последователями африканских местных культов. Конфессиональные различия усугублялись еще расовыми и культурными особенностями.
Север единого Судана населяли арабы и арабизированные народы, относящиеся к европеоидной или переходной эфиопской малой расе.
Южный Судан — это негроиды, в основном — нилоты, исповедующие традиционные культы или христианство (в его местном понимании).
В центральном правительстве в Хартуме (Судан) ключевые позиции заняли мусульмане, отказавшиеся выполнить обещания о создании федеративного государства, что привело к мятежу офицеров-южан и гражданской войне, продолжавшейся с 1955 по 1972 год.
Подписание в 1972 году Аддис-Абебского соглашения привело к прекращению гражданской войны между Севером и Югом и предоставлением Югу определенной автономии в вопросах внутреннего управления.
Перемирие продолжалось примерно 10 лет.
Затем вооруженный конфликт возобновила Народная армия освобождения Судана из-за политики исламизации страны, в рамках которой в 1983 году тогдашний президент Джафар Нимейри разделил южную провинцию Экватория на три отдельные провинции, а в уголовное законодательство страны были введены некоторые виды наказаний, предусмотренных нормами шариата (забивание камнями, публичная порка и отсечение рук).
30 июня 1989 года в результате военного переворота к власти пришел полковник Омар Хассан аль-Башир.
Вторая гражданская война в Судане продолжалась 20 лет и завершилась в 2005 году.
9 января 2005 года правительство и представители южной повстанческой группировки — Суданского народно-освободительного движения/армии (СНОД/А) — подписали Всеобъемлющее мирное соглашение (ВМС), предопределившее существенные изменения во всей структуре государственной власти.
По условиям ВМС в 2005 году сформированы:
правительство национального единства (большая часть портфелей — за правящей партией Национальный конгресс-НК);
автономное правительство Южного Судана, где основные посты заняли представители СНОД/А.
Президент Судана Омар Башир сохранил свой пост до проведения всеобщих выборов. Пост первого вице-президента страны занял лидер СНОД/А Сальва Киир, возглавляющий и правительство Южного Судана.
Путь к независимости Южного Судана начался 11 апреля 2010 года в соответствии с условиями, подписанными ВМС в Судане, предусматривающие первые за четверть века всеобщие выборы.
На севере страны избиратели получили три бюллетеня — для выбора президента страны, губернатора штата, а также депутатов Национальной ассамблеи и местных парламентов из кандидатов, представленных в едином партийном списке, кандидатов от географических округов и отдельного "женского" списка.
Жители юга голосовали за президента и правительство Южного Судана (98,8%).
В соответствии с подписанным ВМС условиями на 9 января 2011 года было намечено проведение референдума по самоопределению Южного Судана. Официально суверенитет Южного Судана был провозглашен 9 июля 2011 года.
В географическом отношении большая часть Южного Судана представлена экосистемой саванных ландшафтов и тропических лесов и только на севере страны располагается небольшая часть пустыни Сахары.
В Южном Судане протекает река Нил, которая образует множество мелких рек, озер и болот по всей территории страны.
Другие реки, такие как Баро и Пибор, также играют важную роль в экосистеме региона.
Рельеф страны преимущественно равниннй и местами заболоченный из-за понижнений суши от 0 до 250 метров над уровнем моря. Большая часть территории прелставляет собойплато и лишь с запада, юго-запада и юга страна отделена от соседних государств горами в среднем от 800 метров на западе и до 2500 метров и выне - на юге.
Климат страны изменяется от пустынного жаркого типа на крайнем севере (показан красным цветом) до жареого полупустынного (желтый цвет) и тропического (синий цвет).
В Джубе (столице) в сезон дождей жарко и душно, в сухой сезон знойно, и весь год облачно. В течение года температура обычно колеблется от +21 до +39 градусов и редко бывает ниже +20 или выше +42 градуса.
Жаркий сезон длится 2,6 месяца (с 16 января по 5 апреля), с максимальной среднесуточной температурой выше + 37 градусов.
Самый жаркий месяц в году в Джубе - март со средним температурным максимумом +38 и минимумом +26 градусов.
Прохладный сезон длится 3,4 месяца (с 10 июня по 21 сентября), с минимальной среднесуточной температурой ниже +32 градуса.
Самый холодный месяц в году в Джубе - август со средним температурным максимумом +21 и минимумом +30 градусов.
Леса Южного Судана покрывают дают древесину лиственных пород, таких как красное дерево и сант (разновидность акации), а также хвойные породы. Гуммиарабик (в Южном Судане его называют камедью Африки), водорастворимая камедь, получаемая из деревьев акации и используемая в производстве клеев, конфет и фармацевтических препаратов, является важной статьей сельскохозяйственного экспорта.
Южный Судан имеет разнообразные уникальные экосистемы, которые
важны для сохранения его богатого биоразнообразия. Среди этих экосистем две выделяются как замечательные примеры естественной среды обитания Южного Судана: крупнейшее водно-болотное угодье в Африке, известное как Судд, и обширные саванны вдоль Белого Нила.
Район Судд известен обширными болотами, каналами и тростниковыми зарослями, занимает площадь около 57 тысяч квадратных километров и служит убежищем для самых разных видов растений и животных, обеспечивая критически важную среду обитания для мигрирующих антилоп и газелей, а игогда и людей.
Судд также является местом обитания редких птиц и служит местом размножения различных морских обитателей вдоль побережья Красного моря, это горячая точка биоразнообразия, в которой развивается богатая флора и фауна, которых нет больше нигде в мире.
Саванны вдоль Белого Нила дополняют уникальные экосистемы Южного Судана. Эти луга являются домом для разнообразия видов растений и животных: от высокой слоновой травы до величественных стад антилоп гну и зебр.
Саванны также служат убежищем для хищных видов, таких как львы, создавая хрупкий баланс в этой естественной среде обитания.
Изменение климата и опустынивание представляют собой серьезную угрозу биоразнообразию Южного Судана. Более 70% территории страны подверглось опустыниванию, что привело к утрате среды обитания и сокращению доступности воды для диких животных.
Программа ООН по окружающей среде (ЮНЕП) предупреждает, что Южный Судан является одной из стран, наиболее уязвимых к изменение климата в Африке. Повышение температуры, изменение характера осадков и увеличение частоты экстремальных погодных явлений — все это влияет на хрупкие экосистемы страны.
Вырубка лесов, вызванная расширением сельского хозяйства, ростом населения и потреблением топливной древесины, усугубляет последствия изменения климата. Утрата лесного покрова ускоряет опустынивание и эрозию почвы, делая экосистемы более уязвимыми к разрушению.
Уменьшение количества осадков в сочетании с неустойчивой практикой землепользования и засухой усиливает риск опустынивания.
Засуха может привести к неурожаю, падежу скота и снижению продовольственной безопасности, что усугубляет уязвимость местных сообществ.
Процесс опустынивания напрямую влияет сельское хозяйство, животноводство и водные ресурсы.
Южный Судан теряет свои леса и водно-болотные угодья, угрожая среде обитания многих видов, включая находящихся под угрозой исчезновения животных, таких как жирафы, львы и слоны.
Опустынивание и вырубка лесов приводят к утрате критически важных мест обитания для видов растений и животных, нарушая экологический баланс и сокращая биоразнообразие.
В Южном Судане встречаются слоны, львы, носороги, жирафы, буйволы, крокодилы, страусы, антилопы и другие виды саванных животных.
Одним из главных занятий многих жителей Южного Судана является охота на крупных диких животных и крокодилов.
Реки страны являются основным источником рыбы, особенно нильского окуня. Большая часть улова потребляется локально.